Стратегија програма дефинише краткорочне и дугорочне специфичне потребе пограничног региона, који доприносе остваривању општег стратешког циља:

Јачање територијалног једниства пограничног региона Бугарске и Србије, конкурентност територије као и одрживост развоја кроз економску и социјалну сарадњу и сарадњу у области заштите животне средине дуж административне границе.

Овај општи циљ програма заједно са кључним елементима стратегије који су препознати у  анализи стања дефинишу специфичне циљеве ИПА прекограничног програма, које треба узети у обзир приликом припреме пројекта.

Специфични циљ 1:   Подршка развоју инфраструктуре која омогућава друштвени и економски напредак и унапређење животне средине са обе стране границе, кроз побољшање квалитета  услуга у области транспорта, информисања и комуникација, као и кроз унапређење прекограничних система у области пружања комуналних услуга и заштите животне средине.

Специфични циљ 2: Јачање економске синергије у региону и унапређење капацитета уз коришћење  заједничког регионалног потенцијала у циљу општег побољшања стандарда у региону, кроз  јачање политичке и друштвене мреже, на основама јаке (прекограничне) економије, унапређење сарадње у одређеним  секторима као што су култура, туризам, истраживање и развој,  заштита животне средине и образовање, и кроз активну размену  најбољих примера из праксе, као и кроз припрему плана за подршку привредном сектору у региону за заједнички наступ и учешће на тржишту Европске уније.

Специфични циљ 3: Промовисање  принципа одрживог развоја у  оквиру програма прекограничне сарадње  у областима од значаја за унапређење међусобног разумевања и поштовања,  кроз развој модела успешне сарадње у пословном сектору,  на нивоу локалних представника интересних група, као и  на политичком нивоу  у областима кључних приоритета.