С оглед постигане на целите, заложени в програмния документ, партниращите си страни съвместно се договориха относно основните направления, в които трябва да се съсредоточат интервенциите по тази програма. Тези основни насоки са наречени приоритетни оси и са, както следва:

Приоритетна ос 1: Развитие на малко (дребно) мащабна инфраструктура;

Приоритетна ос 2: Повишаване на капацитета за съвместно планиране, решаване на проблеми и развитие;

Приоритетна ос 3: Техническа помощ.

Приоритетните оси съдържат ключови сфери (области) на интервенция, както следва:

Приоритетна ос 1: Развитие на малко (дребно) мащабна инфраструктура

1.1 Физическа и информационна инфраструктур;
1.2 Инфраструктура свързана с опазване на околната среда;
1.3 Помощ за подготовка на проект.

Приоритетна ос 2: Повишаване на капацитета за съвместно планиране, решаване на проблеми и развитие

2.1 Създаване на връзки и мрежи за институционално, фирмено и образователно ниво;
2.2 Устойчиво развитие чрез ефективно използване на регионалните ресурси;
2.3 Проекти „От хора за хората”.